Если Вы говорите про окна, выполненные по современным технологиям, то существенной разницы не вижу. Тут скорее надо говорить о вкусе, он то у всех разный. Я, к примеру, выбрал бы здесь https://www.fabrikaokon.ru/derevo.html деревянные окна. Почему? Да потому что они мне больше нравятся и, как я считаю, лучше подойдут для интерьера моей квартиры. Дизайн моей квартиры в ретро стиле, отсюда и мой выбор. У кого в квартире или в доме ремонт и обстановка современные, то наверно пластиковые окна подойдут больше, хотя тут ещё большой вопрос, что лучше. Так что однозначного совета что лучше Вам вряд ли кто-то даст. Сами думайте и решайте.